新的 AI 突破終于可以檢測到寄生蟲感染

感染導(dǎo)致血吸蟲病的寄生蟲的患者的血液樣本包含標(biāo)記疾病不同階段的隱藏信息。

在我們的最近發(fā)表的研究,我們的團(tuán)隊(duì)使用了機(jī)器學(xué)習(xí)發(fā)現(xiàn)隱藏的信息并改善感染的早期檢測和診斷。

導(dǎo)致血吸蟲病的寄生蟲在兩個(gè)宿主中完成其生命周期——首先是蝸牛,然后是人、狗和小鼠等哺乳動(dòng)物。淡水蠕蟲卵通過皮膚進(jìn)入人體宿主,并在全身循環(huán),損害多個(gè)器官,包括肝臟、腸道、膀胱和尿道。

當(dāng)這些幼蟲到達(dá)連接腸道和肝臟的血管時(shí),它們會(huì)成熟為成蟲。然后它們釋放出蟲卵,這些蟲卵在感染者排便時(shí)排出,繼續(xù)傳播周期.

血吸蟲病通常要到疾病晚期才能被診斷出來。(DPDx/CDC)

自診斷以來依賴于檢測糞便中的蟲卵,醫(yī)生通常會(huì)錯(cuò)過感染的早期階段。當(dāng)檢測到蟲卵時(shí),患者已經(jīng)達(dá)到了疾病的晚期。

由于診斷率很低,公共衛(wèi)生官員通常大規(guī)模施用藥物吡喹酮到受影響地區(qū)的人群。然而,吡喹酮不能在感染的早期階段清除幼蟲,也不能防止再次感染。

我們的研究為通過以下方式改進(jìn)早期檢測和診斷提供了一條明確的途徑識(shí)別血液中隱藏的信息這表明活躍的早期感染。

您的身體通過產(chǎn)生涉及多種類型免疫細(xì)胞的免疫反應(yīng)來應(yīng)對(duì)血吸蟲病感染,以及抗體特異性靶向蠕蟲和蟲卵分泌或存在于蠕蟲和蟲卵上的分子。

我們的研究介紹了兩種篩選早期感染信號(hào)抗體的某些特征的方法。

第一個(gè)是捕獲免疫反應(yīng)的定量和定性概況,包括決定它們?nèi)绾闻c其他免疫細(xì)胞通信的各種抗體和特征。這使我們能夠識(shí)別免疫反應(yīng)的特定方面,這些方面將未感染的患者與早期和晚期疾病患者區(qū)分開來。

其次,我們開發(fā)了一個(gè)新的分析抗體的機(jī)器學(xué)習(xí)方法確定與疾病分期和嚴(yán)重程度相關(guān)的免疫反應(yīng)的潛在特征。

我們使用來自感染和未感染患者的免疫概況數(shù)據(jù)訓(xùn)練模型,并使用未用于訓(xùn)練的數(shù)據(jù)和來自不同地理位置的數(shù)據(jù)測試模型。我們不僅確定了該疾病的生物標(biāo)志物,還確定了感染的潛在機(jī)制。

埃及血吸蟲卵簇在膀胱組織中被免疫細(xì)胞包圍。(埃德溫·尤因/疾病預(yù)防控制中心)

看點(diǎn)重要

血吸蟲病是一種被忽視的熱帶病這影響了全球超過 2 億人,每年造成 280,000 人死亡。早期診斷可以提高治療效果并預(yù)防嚴(yán)重疾病。

此外,與許多機(jī)器學(xué)習(xí)方法不同,這些方法黑匣子,我們的方法也是解釋.這意味著它可以提供關(guān)于疾病發(fā)展原因和方式的見解,而不僅僅是識(shí)別疾病標(biāo)志物,指導(dǎo)未來的早期診斷和治療策略。

仍然未知的

我們確定的血吸蟲病感染特征在兩大洲的兩個(gè)地理區(qū)域保持穩(wěn)定。未來的研究可以探索這些生物標(biāo)志物對(duì)其他人群的適用程度。

此外,我們的工作確定了疾病進(jìn)展背后的潛在機(jī)制。我們發(fā)現(xiàn),針對(duì)蠕蟲表面特定蛋白質(zhì)的特定免疫反應(yīng)預(yù)示著感染的中間階段。

了解免疫系統(tǒng)如何對(duì)這種研究不足的抗原做出反應(yīng)可以改善診斷和治療。

下一步

除了提高我們對(duì)免疫系統(tǒng)如何應(yīng)對(duì)感染不同階段的理解外,我們的研究結(jié)果還確定了關(guān)鍵抗原,這些抗原可以為設(shè)計(jì)具有成本效益和高效的診斷和治療方法鋪平道路。

我們的下一步將包括在現(xiàn)場實(shí)際部署這些策略,以便及早發(fā)現(xiàn)和管理疾病。

研究簡報(bào)是關(guān)于有趣的學(xué)術(shù)工作的簡短介紹。

特里魯帕·查克拉博蒂, 綜合系統(tǒng)生物學(xué)博士候選人,匹茲堡大學(xué);阿尼魯?shù)隆に_卡, 生物醫(yī)學(xué)工程助理教授,佐治亞理工學(xué)院吉什努·達(dá)斯,免疫學(xué)和計(jì)算與系統(tǒng)生物學(xué)助理教授,匹茲堡大學(xué)

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